目的 分析和判定广西钦州、靖西、藤县三地广州管圆线虫(A ngiostrongylus cantonensis)分离株的基因差异和系统发生关系. 方法 从广西钦州、靖西、藤县采集野生蛞蝓,分离广州管圆线虫三期幼虫.提取广州管圆线虫三期幼虫的基因组DNA,特异性扩增内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)基因并测序,与GenBank中的广州管圆线虫序列进行比对,分析基因变异.应用Mega5.05软件构建系统发生树,分析系统发生关系. 结果 从三地共采集623条蛞蝓,其中阳性蛞蝓共283条,平均感染率为45.4％.其中靖西感染率最高,为52.4％;藤县和钦州感染率分别为49.1％和19.3％.特异性扩增的ITS2长度为700 bp.GenBank检索获广州管圆线虫(A.cantone ns is)、A.dujardini以及脉居管圆线虫(A.vasorum)的相应序列为对照序列,枯病菌(Rhizoctonia solani)的相应序列为构建系统发生树的根(root)序列.广州管圆线虫钦州分离株、靖西分离株、藤县分离株与GenBank中的广州管圆线虫序列的同源性分别为99.5％、99.5％和99.7％;靖西分离株与藤县分离株、GenBank中广州管圆线虫序列的同源性分别为100％和99.5％;藤县分离株与及GenBank中广州管圆线虫序列的同源性为99.5％.三个分离株与A.dujardini、脉居管圆线虫(A.vasorum)的同源性低.以广州管圆线虫为标准株,靖西分离株有11处碱基变异,变异率为1.93％;钦州分离株有6处,变异率为1.05％;藤县分离株有15处,变异率为2.63％,TG短序列重复插入突变明显.在最大似然法(maximum likelihood method)和邻接法(neighbor-joining method)构建的系统发生树上,靖西、钦州及藤县的分离株与广州管圆线虫同属一个分枝,系统发生关系较近,A.dujardini、脉居管圆线虫居于另一分枝. 结论 广西三地的广州管圆线虫分离株存在较高的遗传多态性,与GenBank中的广州管圆线虫同源性高,亲缘关系近,初步判断三个分离株与GenBank中广州管圆线虫为同一虫种。
广西三地广州管圆线虫亲缘关系研究
【摘 要】
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目的 分析和判定广西钦州、靖西、藤县三地广州管圆线虫(A ngiostrongylus cantonensis)分离株的基因差异和系统发生关系. 方法 从广西钦州、靖西、藤县采集野生蛞蝓,分离广州管圆线虫三期幼虫.提取广州管圆线虫三期幼虫的基因组DNA,特异性扩增内转录间隔区2(internal transcribed spacer 2,ITS2)基因并测序,与GenBank中的广州管圆线虫序列进
【机 构】
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530021南宁,广西医科大学,530028南宁,广西壮族自治区疾病预防控制中心,530028南宁,广西壮族自治区疾病预防控制中心,710054西安,陕西武警总队医院,530028南宁,广西壮族自治区
【出 处】
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国际医学寄生虫病杂志
【发表日期】
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2013年40期
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