【摘 要】
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生物RNA二级结构预测是生物信息学领域的一个重要研究问题。近来,研究人员提出应用元启发式算法来预测RNA二级结构。该文提出基于禁忌遗传算法的RNA二级结构预测方法(TGARNA)
【机 构】
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电子科技大学计算机科学与工程学院成都611731,苏州大学江苏省计算机信息处理技术重点实验室江苏苏州215006,四川建筑职业技术学院图书馆四川德阳618000
【基金项目】
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国家自然科学基金(60903074);国家高技术研究发展计划(2008AA01Z119)
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生物RNA二级结构预测是生物信息学领域的一个重要研究问题。近来,研究人员提出应用元启发式算法来预测RNA二级结构。该文提出基于禁忌遗传算法的RNA二级结构预测方法(TGARNA),给出茎区相容性检测改进方法,保留最长茎区构造茎区相容个体,以改善种群性能;同时将禁忌搜索融入遗传操作以防止近亲繁殖,保持种群多样性。仿真实验表明TGARNA算法能够有效预测RNA二级结构。
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