【摘 要】
：
目的 利用癌症基因图谱(TCGA)数据评估分析人线粒体转录延伸因子(TEFM)基因在原发性肝癌中的表达及临床意义,为原发性肝癌的诊治提供新思路.方法 从TCGA中下载肝癌数据集,获
【机 构】
：
徐州医科大学研究生院,江苏徐州221000;徐州医科大学消化病研究所,江苏徐州221000;徐州医科大学附属医院普外科,江苏徐州221000;徐州医科大学附属医院普外科,江苏徐州221000;徐州医科
论文部分内容阅读
目的 利用癌症基因图谱(TCGA)数据评估分析人线粒体转录延伸因子(TEFM)基因在原发性肝癌中的表达及临床意义,为原发性肝癌的诊治提供新思路.方法 从TCGA中下载肝癌数据集,获得TEFM基因表达谱和临床数据;利用R语言及Perl语言对数据进行整理分析,比较肝癌组织及癌旁组织中TEFM表达量差异,并分析表达量与患者生存时间的关联性;通过Wilcoxon检验、Kruskal-Wallis检验及logistic回归进行临床关联性分析;利用基因富集化分析及蛋白相互作用网络分析TEFM可能参与的信号通路及潜在靶基因.结果 与正常肝组织相比,TEFM基因在肝癌组织中高表达(FPKM=424,W=3 591.00,P＜0.05);TEFM基因高表达患者的5年生存率较低(x2=32.243,DF=1,P＜0.05);TEFM基因表达量与临床病理分级(x2=19.082,DF=3,P＜0.05)、病理分期(x2=13.373,DF=3,P＜0.05)、肿瘤原发灶情况(x2=10.276,DF=3,P＜0.05)关联;TEFM基因可以作为原发性肝癌独立预后因子(P＜0.01);与TEFM基因编码蛋白相互作用的蛋白有POLRMT、TFB2M、MTERF1、MRPL21、ATAD5、TRMT10C、ADAP2、RAB11FIP4和CRLF3等;TEFM高表达样本富集到细胞周期、碱基修复、转录、RNA降解等相关基因集.结论 TE-FM可作为一种促癌基因,调控线粒体基因组转录,参与肝细胞癌的发生发展,有望为肝细胞癌的诊断与治疗提供新的靶点.
其他文献
目的 探讨白花丹素(PB)通过对上皮间质转化的抑制从而调控卵巢癌细胞SKOV3侵袭和迁移能力的作用和机制.方法 将卵巢癌细胞分为Control组、PB(1 μmol/L)组、PB(2 μmol/L)组
目的研究肝豆状核变性(WD)患者血清超氧化物歧化酶(SOD)活性变化与肝功能、铜生化指标的相关性。方法选择2017年7月—2019年2月本院收治的267例肝豆状核变性(WD)患者(病例组)
目的 探讨细胞程序性死亡蛋白1 (PDCD1)、程序性死亡因子配体-1(PD-L1)和细胞毒性T淋巴细胞抗原4(CTLA-4)联合检测对非小细胞肺癌(NSCLC)的临床应用价值.方法 收集2012-01-01
目的 采用Meta分析方法评价18F-脱氧葡萄糖正电子发射计算机体层摄影(18F-FDG PET/CT)和增强CT(CECT)诊断经导管肝动脉化疗栓塞术(TACE)术后存活或复发病灶的临床价值.方法
目的 研究初诊弥漫大B细胞淋巴瘤(DLBCL)患者经R-CHOP(样)方案治疗1个周期后,出现化疗诱导的中性粒细胞减少(CIN)程度与近期疗效及预后的关系,分析CIN对近期疗效及预后的影响
目的 主要从基因DNA甲基化修饰与胃肠肿瘤发生发展、化疗药物靶点、作为早期诊断标志物等进展进行综述.方法 应用PubMed及中国知网数据库检索系统,以中文关键词“DNA甲基化、
目的 探讨延长辅助内分泌治疗能否改善激素受体阳性早期乳腺癌患者的预后,为临床治疗方案提供参考依据.方法 检索PubMed、ASCO会议和圣安东尼奥会议报告,以及相关中文数据库
乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一[1-2],三阴性乳腺癌(triple-negative breast cancer,TNBC)是其中恶性程度最高、预后最差的一类亚型.10％～20％的乳腺癌为TNBC,与其他亚型不同之
目的探究儿童细菌性坏死性肺炎(BNP)与肺炎支原体坏死性肺炎(MPNP)的白细胞计数(WBC)、C反应蛋白(CRP)、降钙素(PCT)以及B型利钠肽的水平与预后的差异。方法选择2018年3月—2
目的 探讨在线红外定位系统在鼻咽癌放射治疗中对摆位误差的控制及不同计划靶区(planning target volume,PTV)外放对危及器官剂量的影响.方法 选取2017-04-03-2018-11-20南通