基于重测序‘墨地龙’冬瓜In Del标记的开发及纯度鉴定

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为建立一个简捷、经济、准确可靠的杂交冬瓜种子纯度鉴定方法,通过对‘墨地龙’冬瓜父母本进行全基因组重测序,开发差异显著的InDel标记;以‘墨地龙’杂交种及其父母本为供试DNA,利用开发的InDel分子标记对‘墨地龙’冬瓜杂交种子进行纯度鉴定,同时和田间鉴定结果进行对比。通过基因组重测序筛选出‘墨地龙’冬瓜亲本差异InDel标记共466对,选择其中差异较大的26条进行扩增,发现均可扩增出条带,其中7对引物可明显区分冬瓜样品纯度。InDel分子标记鉴定的纯度与田间小区种植鉴定结果的吻合度达99%以上,表明不同方法获得‘墨地龙’纯度结果高度一致。本研究筛选的In Del分子标记可用于‘墨地龙’冬瓜杂交种的纯度鉴定。
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