目的评价BACTEC MGIT 960全自动分枝杆菌培养及药物敏感试验、结核分枝杆菌耐药基因芯片法、实时荧光PCR熔解曲线法三种方法检测结核分枝杆菌耐药的临床效能。方法搜集2015年4月至2016年8月在黑龙江省传染病防治院就诊,同时应用BACTEC MGIT 960全自动分枝杆菌培养及药物敏感试验、结核分枝杆菌耐药基因芯片法、实时荧光PCR熔解曲线法三种检测方法临床确诊的耐多药肺结核病例,分析检测结果。结果总计25例,初治5例中有1例在早期经基因芯片检测提示异烟肼、利福平均发生突变,抗结核治疗一周后才留痰做溶解曲线检测,结果均未检出,而药物敏感试验结果显示异烟肼、利福平、左氧氟沙星耐药;在初治和复治病例中各有1例基因芯片和溶解曲线检测异烟肼均发生突变,而药物敏感试验结果显示敏感;在初治病例中除1例溶解曲线检测氟喹诺酮类药物未检出外,其余4例均未发生突变,且药物敏感试验结果显示左氧氟沙星、莫西沙星均敏感;在复治病例中有11例溶解曲线检测氟喹诺酮类药物发生突变,药物敏感试验结果显示左氧氟沙星有9例耐药、2例敏感,莫西沙星有2例耐药、9例敏感;在复治病例中溶解曲线检测氟喹诺酮类药物未发生突变的7例病例,药物敏感试验结果显示左氧氟沙星、莫西沙星均敏感。结论在耐药结核病防治中应该根据不同的检测目的选用适宜的检测方法,建议在有条件地区或者耐药结核病发生率较高地区,应该开展基因芯片或溶解曲线的早期筛查,尤其是复治病例更应该把溶解曲线检测做为常规,同时结合药物敏感试验以确保耐药结核的早期发现、精准治疗。