【摘 要】
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为了探究影响香猪生长发育的功能基因,本试验利用Illumina Porcine SNP60K芯片筛选出N乙酰氨基半乳糖转移酶2 (polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2,GALNT2)基
【机 构】
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贵州大学生命科学学院,贵州大学农业生物工程研究院,贵州大学动物科学学院
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为了探究影响香猪生长发育的功能基因,本试验利用Illumina Porcine SNP60K芯片筛选出N乙酰氨基半乳糖转移酶2 (polypeptide N-acetylgalactosaminyltransferase 2,GALNT2)基因内含子10中一个与腹围呈弱相关的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点rs80894395.在此基础上应用等位基因特异性PCR(allele-specific PCR,AS-PCR)技术检测520头雌性香猪群体中该位点的基因型,并与43头大白猪、36头柯乐猪相比较.结果表明,从3个猪群体中检测到rs80894395位点的CC、CT和TT 3种基因型;其中香猪群体以CT为优势基因型,且基因型与香猪的体重、体长和腹围呈弱的正相关;大白猪群体以CC基因型为主,T等位基因频率较香猪极显著减少(P＜0.01);柯乐猪群体中CC与CT基因型频率相等,与香猪和大白猪的基因频率间的差异不显著(P＞0.05).生物信息学分析表明,rs80894395位点可能影响GALNT2基因的剪接过程.rs80894395与香猪的生长发育可能有一定的联系.
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