【摘 要】
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化学结构相似性检索在现代化学研究中具有重要作用.而化学结构的相似性度量是进行相似度检索的基础和前提.目前在化学信息学的研究中,有数量众多的化学结构距离度量和相似度
【机 构】
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信息服务工程北京市重点实验室,中国医学科学院药用植物研究所,生化工程国家重点实验室
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化学结构相似性检索在现代化学研究中具有重要作用.而化学结构的相似性度量是进行相似度检索的基础和前提.目前在化学信息学的研究中,有数量众多的化学结构距离度量和相似度表示方法.本文采用了Daylight的分子指纹方法,并采用了Tanimoto系数定义的相似度度量方法.并根据这种度量方法使用CDK来进行计算化学结构的相似度指数.在上述研究工作的基础上,开发了基于浏览器/服务器模式的化学结构相似度检索系统,通过该系统可以在中药活性成分数据库中进行化学结构相似度检索.用户在进行化学结构相似度检索时,可以选择已存在的化学结构,也可以采用JME来绘制新的化学结构.下一步将在该数据库中进行聚类分析和分子多样性的研究.
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