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目的
建立新型弯曲菌—"胎儿弯曲菌龟亚种(C.fetus subsp.testudinum)"质谱超级图谱库，为临床提供新的检测平台。
方法对收集的建库菌株采用Illumina二代测序平台2000/miSeq进行高通量全基因组测序，JAVA 8运行环境，进行直系同源基因的全基因组平均核苷酸一致性(average nucleotide identity，OrthoANI)分析；对收集的实验菌株、标准菌株及对照菌株进行质谱分析，建立"C.fetus subsp.testudinum"的超级图谱并验证。
结果OrthoANI分析得出：建库菌株与模式菌株C.fetus subsp.testudinum03－427的OrthoANI值为：99.30%～99.96%，而其与C.fetus subsp.venerealisNCTC10354、C.fetus subsp.fetus82－40的OrthoANI值在91.05%～92.26%。参考OrthoANI≥95%作为同一菌种的判定依据，故将建库菌株最终鉴定为"胎儿弯曲菌龟亚种"。新建的超级图谱库鉴定准确率100%(与基因测序一致)，可信度区间为：82.3%～99.9%，同一菌株鉴定重复性100%。
结论基于高通量测序及全基因组学分析的微生物分类新"金标准"为实验室质谱自建库提供了理想的参考价值，而建立准确、客观的"C.fetus subsp.testudinum"质谱超级参考图谱，为临床快速诊断胎儿弯曲菌感染提供了新的平台。(中华检验医学杂志，2018, 41：583－588)