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基因表达数据具有高维、小样本、多噪声和高冗余的特点，使传统聚类方法效率较低．子空间分割是高维数据聚类的有效手段，但直接对基因表达数据进行子空间分割会降低聚类性能．为了更有效地聚类，文中提出低秩投影最小二乘回归子空间分割方法．首先利用改进的低秩方法将数据投影至潜在子空间，以便去除数据中可能的毁损，得到较干净的数据字典．然后采用最小二乘回归方法获得数据低维表示并构造仿射矩阵，利用该仿射矩阵实现聚类．在6个公开基因表达数据集上的实验表明文中方法的有效性．