基于转录组的百香果ARF基因家族的鉴定及表达分析

来源 :福建农林大学学报:自然科学版 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chenchenyaya
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基于转录组数据对百香果ARF基因家族(PeARFs)进行鉴定,利用生物信息学软件分析其编码蛋白的理化性质、保守结构域、保守基序、系统进化情况,同时比较了它们在‘福建3号’(黄果)和‘福建1号’(紫果)不同果实成熟阶段的表达差异.共鉴定得到13个PeARF成员,其编码的蛋白质含有365~970个氨基酸,分子质量约为39.95~106.33 ku,等电点为5.40~8.94.保守结构域分析结果显示,所有PeARF蛋白质均具有典型的B3和Auxin-resp结构域,仅4个成员(PeARF6、PeARF8、PeA
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