【摘 要】
：
目的通过生物信息分析途径，从系统水平揭示参与急性B淋巴细胞白血病（B-ALL）发病的分子机制，为研究提供新的思路。方法从公共数据库GEO中下载B- ALL的microRNA (miRNA）芯片数据，利用Qlucore Omics Explorer 3. 0软件筛选差异表达miRNA，再分析得到差异miRNA与靶基因、长链非编码RNA和转录因子各自的调控数据，然后构建以差异miRNA为中心的综合调控
【机 构】
：
510515 广州，南方医科大学基因工程研究所,510515 广州，南方医科大学基因工程研究所,510515 广州，南方医科大学基因工程研究所,
论文部分内容阅读
目的通过生物信息分析途径，从系统水平揭示参与急性B淋巴细胞白血病（B-ALL）发病的分子机制，为研究提供新的思路。
方法从公共数据库GEO中下载B- ALL的microRNA (miRNA）芯片数据，利用Qlucore Omics Explorer 3. 0软件筛选差异表达miRNA，再分析得到差异miRNA与靶基因、长链非编码RNA和转录因子各自的调控数据，然后构建以差异miRNA为中心的综合调控网络。另外，功能富集分析有功能的靶基因。
结果共筛选出15个差异miRNA，其中7个miRNA表达上调，8个miRNA表达下调。通过差异miRNA为中心的综合调控网络可知，hsa-miR-126和hsa-miR-486-3p调控大量的靶基因，其中hsa-miR-126的靶基因包括MYC基因。hsa-miR-29a、hsa-miR-130a和hsa-miR-181c调控大量的长链非编码RNA，包括XIST。hsa-miR-181a-2、hsa-miR-181b-2和hsa-miR-663调控大量的转录因子，包括CDX2、YY1等。hsa-miR-126靶基因的通路分析显示富集到Wnt通路。
结论通过生物信息学方法分析得出，hsa-miR-29a、hsa-miR-126和hsa-miR-181家族是B-ALL的核心差异miRNA，及其转录因子CDX2、长链非编码RNA XIST和靶基因MYC基因在B-ALL的发生发展中起重要作用，可能为潜在的治疗靶点。
其他文献
李实在城里收废品,收到第三年上认识了菜花,两个人便经常合作,去收旧家具.收旧家具至少得两个人.如今城里的很多院子,都不让进三轮踏车,只好一个人进去喊收旧家具的来了,一个
以计算机视觉和视觉检测中的摄像机标定过程作为研究的对象,分析了开源计算机视觉函数库OpenCV中的摄像机模型,使用张正友基于平面模板的方法进行标定,过程中充分考虑了透镜
多示例学习是一种新的机器学习斱法。本文将多示例学习应用到图像检索上,提出一个基于多示例学习的图像检索斱法。将图像检索置换成多示例学习,把图像看作多示例学习中的包,图像分割后的多个区域看作包中的示例,幵引入相兲反馈技术优化图像检索。提出的检索斱法在Corel图像集上获得了较好性能。
在新时代下,教育的理念也要有“新”的特点.时代发展的脚步越来越快,教育作为社会生活的重要组成部分,应该回归“本真”.教育,是思想的传递,而不是文化手段的传递.新时代下的
目的 探讨脓毒症易感性与IRAK—M基因多态性的关系。方法选择脓毒症患者82例为实验组，118例健康人群为对照组。应用聚合酶链反应（PCR）-限制性片段长度多态性分析法（RFLP）分析IRAK—M＋22148G〉A基因多态性。结果脓毒症组IRAK—M＋22148G〉A位点G／G基因型频率高于对照组（81．7％比28．8％），差异有统计学意义（P〈0．01），G等位基因频率高于对照组（84．1％比3
目的 评价JAK2、MPL和CALR基因突变在中国原发性骨髓纤维化(PMF)患者中的预后意义.方法 回顾性分析402例PMF患者的临床资料及JAK2、MPL和CALR基因突变,应用Kaplan-Meier、Log
本文分析了辽宁省防汛抗旱信息化建设现状,剖析存在的问题,提出发展思路和建设构想,并对推进防汛抗旱信息化建设提出了几点建议。
目的 探讨环氧化物水解酶( EPHX2)基因rs751141位点基因多态性与新疆哈萨克族、汉族原发性高血压之间的相关性.方法 分别选择新疆哈萨克族267例,汉族原发性高血压患者368例,同时选取哈萨克族、汉族正常对照组284例和348例,用Hardy-Weinberg平衡检验样本群体代表性,采用TaqMan探针法对EPHX2基因rs751141位点基因多态性进行检测.结果 新疆汉族原发性高血压组r
目的 通过与传统汗腺分离方法进行对比，建立一种新的快速分离、获取人汗腺方法。方法采用制作微粒皮（直径0．5～1．0mm^3）、提高胶原酶Ⅱ型的浓度（2．5g／L）以及改变温度条件（37．5℃）来与传统方法比较，对比两种方法获取汗腺的时间、细胞的形态及增殖情况。结果由此方法分离、获取汗腺细胞所需要的时间明显缩短（由12h以上缩短为3～5h），其形态及增殖特性无明显差异（P〉0．05）。结论一种更加便
据中国科学院文献情报中心网站消息,中国科学引文数据库(CSCD)2017-2018年来源期刊列表于2017年4月21日发布。经过中国科学引文数据库(Chinese Science Citation Database,简