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肠道微生物引起肥胖病的致病机理一直受到广泛关注，而从大肠杆菌中分离到的脂多糖内毒素是近年来唯一发现的与肥胖相关的细菌代谢产物。通过将该物质皮下注射给小鼠（Musmusculus），能够引起小鼠肥胖同时产生胰岛素抗性。研究表明，在各种肥胖群体样本中都能检测到内毒素产生菌数量和内毒素含量的增加，但是却没有数据证明内毒素产生菌能够直接引起人类肥胖。