【摘 要】
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瞬时蛋白-蛋白作用在细胞内有着重要的生理作用,所形成的界面为瞬时蛋白-蛋白界面.作为电子传递功能相关瞬时界面的代表,细胞色素P450被广泛的研究.本文选取具有高效电子传递
【基金项目】
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国家高技术研究发展计划(863计划);
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瞬时蛋白-蛋白作用在细胞内有着重要的生理作用,所形成的界面为瞬时蛋白-蛋白界面.作为电子传递功能相关瞬时界面的代表,细胞色素P450被广泛的研究.本文选取具有高效电子传递效率的P450BM3蛋白作为研究素材,在其HEME域上选择了9个设计位点.通过在能量函数中引入特异性能量函数项,取得了较好的设计结果,有6个位点的残基类型与天然蛋白的残基类型一致.另外,本文还探讨了计算模型中加入水分子的重要性,说明了水分子在提供范德华能和氢键能方面的作用.
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