利用GoldenGate分析的高通量SNP芯片对鲤基因进行分型

来源 :水产学杂志 | 被引量 : 0次 | 上传用户:huangma2009
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单核苷酸多态性(SNPs)标记在大多数物种基因组中数量巨大且分布均匀,是许多水产物种遗传研究的理想标记,因此快速发展了几种高通量、快速的SNP标记分型平台。本研究利用Golden Gat。分析技术对鲤Cyprinuscarpio转录组测序的1536个SNP标记合成了一张中等密度SNP芯片,对5个鲤群体的480份样本进行基因分型。结果表明:1235个SNP标记成功分型,约占80%;915个标记至少在一个家系中呈现多态性。占74.1%;标记最小等位基因频率(MAF)介于0.05~0.5之间,平均为0.334,
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