马铃薯α-淀粉酶基因的克隆及生物信息学分析

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【摘要】

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利用RT-PCR方法从马铃薯（Solanum tuberosum）茎段总RNA中扩增、克隆amyA1基因（NCBI登录号GQ406048.1）。采用半定量RT-PCR方法检测amyA1基因在马铃薯茎、叶等不同组织中的表达强度

【作者】

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王永刚马建忠马雪青周贤婧李昆鹏赵虎彪

【机构】

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兰州理工大学生命科学与工程学院

【出处】

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食品科学

【发表日期】

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2010年19期

【关键词】

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马铃薯 Α-淀粉酶基因克隆生物信息学 potato α-amylase cloning bioinformatic analysis

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利用RT-PCR方法从马铃薯（Solanum tuberosum）茎段总RNA中扩增、克隆amyA1基因（NCBI登录号GQ406048.1）。采用半定量RT-PCR方法检测amyA1基因在马铃薯茎、叶等不同组织中的表达强度,表明在茎组织中的表达丰度略高。利用生物信息学软件分析amyA1密码子的偏好性;同时对AmyA1氨基酸的理化性质、细胞内定位、保守结构及高级结构进行预测。基于NCBI数据库中有物种代表性的29种α-淀粉酶基因序列构建了基因进化树。amyA1基因全长1224bp,可编码一条理论分子质量为

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