【摘 要】
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目的 分析研究自中段尿培养中分离鉴定出的无迁徙性生长β溶血普通变形杆菌KM-19的生物学特性、耐药机制及基因组特点,为临床合理用药提供指导。方法 常规方法分离培养菌株;
【机 构】
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云南省第三人民医院检验科微生物室;
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目的 分析研究自中段尿培养中分离鉴定出的无迁徙性生长β溶血普通变形杆菌KM-19的生物学特性、耐药机制及基因组特点,为临床合理用药提供指导。方法 常规方法分离培养菌株;采用VITEK-2 Compact全自动微生物分析仪进行菌种鉴定和体外药物敏感性试验;利用鞭毛染色和半固体动力试验观察鞭毛缺失情况;采用高通量测序技术对该菌全基因组测序,采用生物信息学方法进行序列组装、基因预测与功能注释,并深入挖掘菌株的表型机制及耐药机制相关基因簇信息。结果 VITEK-2 Compact鉴定结果为普通变形杆菌。全基因组测序结果显示基因组组装共得48个重叠群,基因总长度3 319 152 bp,平均长度904.89 bp,占基因组全长的85.50%,无重复序列,鸟嘌呤(G) 和胞嘧啶(C) (G+ C )含量38%。该菌比对到普通变形杆菌可信度最高,也验证了VITEK-2 Compact鉴定结果准确。该菌对一二代头孢菌素、氨苄西林、呋喃妥因、复方新诺明、替加环素耐药,其余均敏感。鞭毛染色油镜下未见鞭毛结构,半固体动力试验阴性;基因组测序序列与VFDB数据库比对结果显示细菌鞭毛基因及相关基因未缺失,但鞭毛基因序列中发现可接受甲基化的趋化性蛋白基因III/I位点和甲基转移酶基因,还有溶血素基因(HlyB)。基因组序列与CARD数据库比对结果显示基因序列存在OXY型和CTX-M型基因及主动外排泵基因。结论 该株菌无迁徙性生长现象,其主要机制可能是鞭毛基因或相关基因被甲基化,使细菌不能有效表达菌体外鞭毛蛋白,丧失迁徙生长能力;β溶血表型可能由外源性溶血素基因(HlyB)插入细菌基因组中并有效表达。该菌体外耐药情况与OXY型和CTX-M型基因及主动外排泵基因密切相关。
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