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于2005年11月和2006年2月对长江口青草沙水库规划区及周边水域开展了两次大规模的水文水质调查。结果表明,青草沙水库规划区主要水质因子浓度基本能够满足《地表水环境质量标准(》GB 3838—2002)的Ⅱ类标准;但由于径流量变化、盐水入侵等因素的影响,部分水质因子浓度在枯水期偏高,成为影响水库水质的潜在因素;青草沙水库规划区上游水质明显优于下游,在同一断面上南港水质比北港更易受陆源排放物的影响;建成后的青草沙水库与黄浦江上游水源地、陈行水库一起组成原水输配网络,能够为上海市饮用水的安全提供保障。