【摘 要】
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基于DNA分子二级结构的结构稳定性和热力学稳定性,提出一种预测DNA分子二级结构的算法.利用基于矩阵的动态规划算法求解DNA分子最大碱基对匹配的所有二级结构;利用Nearest-Ne
【基金项目】
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基金项目：国家自然科学基金项目（61100055、61033003、60974112、91130034）,湖北省自然科学基金项目（2011CDB233）
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基于DNA分子二级结构的结构稳定性和热力学稳定性,提出一种预测DNA分子二级结构的算法.利用基于矩阵的动态规划算法求解DNA分子最大碱基对匹配的所有二级结构;利用Nearest-Neighbor热力学模型计算所有结构的自由能,自由能在阈值范围内的即为DNA分子可能的二级结构.将实验结果与RNAstructure软件结果进行对比,对比结果表明,该方法具有较高的准确率和覆盖范围.
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