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本文以来自国内外的20株白菜黑斑病菌及近源种为研究材料,进行了5.8S rDNA及其侧翼ITS区的克隆、测序、序列变异及遗传进化关系分析.黑斑病菌及其近源种真菌核糖体5.8S rDNA及其侧翼ITS区序列比对结果显示,不同种菌株ITS1比ITS2在碱基构成上有更大变异,而且ITS1的序列长度变异比ITS2的大;而种内虽然各菌株的寄主和地理来源不同,但ITS1和ITS2在长度上均没有变异,碱基构成上存在微小的变异.对该区序列的聚类分析表明,白菜黑斑病菌3个种芸薹链格孢Alternaria brassicae、甘蓝链格孢A.brassicicola和萝卜链格孢A.japonica虽然地理来源和寄主不同,但种内的不同菌株均在一个独立的聚类组中,种之间以及其和链格孢属内其它种在聚类关系上能明显分开,可基于该区进行黑斑病菌的分类鉴定.