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进化论在近代中国得到广泛传播后，对东西方文化的评判产生重要影响，作为当时中西文化论争一部分的中西医论争自不可避免。进化论思想使中医得到“落后”的价值评价，在现实中给予了批判中医论者政治上的正当性，并成为他们废止中医的思想来源之一；同时，由于被评价为“落后、迷信、不科学”，中医表达自身的话语权也逐渐发生了转移，造成了中医的“失语”。