【摘 要】
:
目的通过对预测得到的miR-155靶基因进行生物信息学分析,探索和比较DAVID(Database forAnnotation,Visualization and Integrated Discovery)及BiNGO(Biological Networks Ge
【机 构】
:
福建医科大学公共卫生学院流行病与卫生统计学系
论文部分内容阅读
目的通过对预测得到的miR-155靶基因进行生物信息学分析,探索和比较DAVID(Database forAnnotation,Visualization and Integrated Discovery)及BiNGO(Biological Networks Gene Ontology tool)软件在基因本体(GO)及生物学通路富集分析中的应用,以期为miR-155靶基因的实验验证及生物学功能的研究提供理论指导。方法利用TargetScan 6.0预测得到的miR-155靶基因作为分析的基因集合,通过BiNGO及DAVID对这个靶基因集合进行GO富集分析和生物通路富集分析,并对两个软件的富集分析结果进行比较和分析。结果 miR-155的预测靶基因集合分别富集在转录调控活性、蛋白激酶活性等分子功能上和代谢调控、转录调控、高分子生物合成、基因表达调控及信号转导等生物学过程中(P<0.01);进一步分析显示该基因集合在KEGG代谢通路数据库中,显著富集于T细胞受体信号通路、B细胞受体信号通路、MAPK信号通路、ErbB信号通路等7个信号通路和结直肠癌、急慢性髓性白血病等7个疾病通路中(P<0.05)。结论 BiNGO和DAVID软件在miRNAs靶基因富集分析中各有优势,可以结合两个软件的分析结果对miRNAs靶基因集合进行生物学描述,为进一步的功能研究提供生物信息学指导。
其他文献
本文以"卓越工程师教育培养计划"为背景,介绍了德国应用科学大学和美国欧林工学院工程型本科教育教学模式,总结了工程教育先进教育理念,并以此为基础提出了华北科技学院采矿工
网络文化产业方兴未艾,市场潜力巨大,有着良好的发展前景。本文以丰富详实的数据剖析了广东网络文化产业的发展现状,并针对其发展过程中出现的问题,提出了相应的对策建议。
研究了VHT800立式车铣加工中心立柱结构的静动态优化及轻量化设计方法,解决了企业经验设计结构存在的静、动态性能不足以及结构过于笨重的问题。首先基于机床实际典型工况下
综述了近20年来世界杀菌剂新品种的开发进展,重点介绍了三唑类、酰胺类、嘧啶胺类、甲氧基丙烯酸酯类杀菌剂,并对21世纪杀菌剂工业发展的一些新特点进行了讨论。
<正>肩关节前脱位全并肱骨解剖颈骨折是一种严重的复杂损伤,临床少见,治疗效果常不满意.我院自1983年至1987年收治4例.本文通过4例手术所见和3例尸体解剖观察,结合文献复习,
李清照是我国宋代词坛上一位大家,在她的《词论》里提出了“词别是一家”的著名论断,要求填词必需严格按照协律、铺叙、重典、情致和故实等五个标准进行创作,缺一不可。她提出的
在水—甲苯二元非均相体系中,以PEG-800为相转移催化剂,由邻苯二酚、一氯甲烷和氢氧化钠合成了愈创木酚。得出了最佳反应条件:n(邻苯二酚)∶n(一氯甲烷)∶n(NaOH)=1.0∶1.4∶1.1(mol∶mol∶mol),反应温度为140℃,反应时间为4h,PEG-800用量
中小企业在一个地区的经济和社会发展中具有战略性的基础地位。长期以来,中小企业虽是我国国民经济保持快速增长的重要力量,但在保证县域经济持续、健康、稳定发展中却得不到
新型异唑啉类杀虫剂fluralaner通过干扰γ-氨基丁酸(GABA)门控氯离子通道发挥作用。作为新型高效GABA门控氯离子通道干扰剂,与环戊二烯类、苯基吡唑类和大环内酯类杀虫剂相
交通拥堵一直是困扰大都市发展的重要问题,城市对交通拥堵的治理状况也是城市管理水平的重要标志。21世纪以来,随着机动车拥有量的猛增,中国大都市的交通拥堵问题也日益严峻,