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植物染色体加倍后的表型变化与基因的表达密切相关。本研究对1份二倍体和3份四倍体西瓜材料进行转录组测序并分析差异表达基因。结果表明,二倍体和四倍体西瓜的差异表达基因显著富集的GO term为细胞氮化合物生物合成过程、光系统、半胱氨酸型内肽酶抑制剂活性、氧化还原酶活性以及类囊体等,KEGG富集分析中发现差异表达基因在光合作用、光合作用天线蛋白、叶绿素和卟啉代谢、乙醛酸和二羧酸代谢等通路较为活跃。二倍体和四倍体西瓜中高水平差异基因大都是上调表达,氧化应激蛋白、脱落酸受体、乙烯响应转录因子等差异表达基因可能是西瓜