α2A-肾上腺素受体的同源模建及与Yohimbine的对接研究

来源 :物理化学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户：liongliong535

【摘要】

：

通过对比多个与α2A-肾上腺素受体同属G-蛋白偶联受体的视紫红质蛋白序列,选择以相似性最大的牛视紫红质蛋白为模板,同源模建了α2A-肾上腺素受体的跨膜结构,并在结构中找到

【作者】

：

赵立峰丁晓琴丁俊杰陈冀胜

【机构】

：

北京药物化学研究所

【出处】

：

物理化学学报

【发表日期】

：

2005年2期

【关键词】

：

跨膜蛋白 α2A-肾上腺素受体同源模建对接 YOHIMBINE Transmembrane protein -adrenergic receptor Hom

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通过对比多个与α2A-肾上腺素受体同属G-蛋白偶联受体的视紫红质蛋白序列,选择以相似性最大的牛视紫红质蛋白为模板,同源模建了α2A-肾上腺素受体的跨膜结构,并在结构中找到了体积为0.090 nm3,已被报导的活性残基包围的活性位点.运用分子力学与动力学方法研究了此结构突变前后与抑制剂Yohimbine的对接情况,得到了与文献报道相吻合的结果.同时对接研究结果发现,在α2A-肾上腺素受体的结合位点周围的一个由色氨酸和两个苯丙氨酸组成的局部疏水区对抑制剂有稳定作用,并且天冬氨酸113作为氢键受体也对稳定抑制剂

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