【摘 要】
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目的:筛选出特异性靶向PPARγ的配体,为降糖药物的研发提供思路.方法:以核受体PPARγ配体结合区域的晶体结构作为靶点,运用Schrodinger分子对接技术虚拟筛选Drugbank中老药分
【机 构】
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郑州大学第二附属医院药学部,河南郑州450014;郑州大学第二附属医院重症医学科,河南郑州450014;厦门大学药学院,福建厦门361102
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目的:筛选出特异性靶向PPARγ的配体,为降糖药物的研发提供思路.方法:以核受体PPARγ配体结合区域的晶体结构作为靶点,运用Schrodinger分子对接技术虚拟筛选Drugbank中老药分子化合物,结合打分值以及化合物与靶蛋白受体的相互作用模式优化筛选结果,获得具有降糖潜在活性的小分子化合物.结果:经过SP和XP两轮筛选得到7种化合物,结合模式与晶体中的原配体罗格列酮基本一致,化合物伸展姿势与整个口袋形状可以较好地相互匹配,而且对接打分都明显优于罗格列酮,进而比较了配体效力,化合物分子与结合口袋中氨基酸残基形成的氢键数目和对接能量值,显示艾曲波帕和雷替曲塞两个化合物表现最优.结论:来源于Drugbank老药库中的7种化合物具有潜在靶向PPARγ的活性,从而发挥降血糖作用,其中艾曲波帕和雷替曲塞可优先选择进行降糖药物的研究.
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