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本文对登革2型04株病毒结构蛋白基因的核苷酸及氨基酸序列进行了分析。结果表明D2-04株结构蛋白基因含2325个核苷酸，编码3个结构蛋白：衣壳蛋白（C）、膜蛋白前体（prM）、膜蛋白（M）和包膜蛋白（E），氨基酸总数为775。蛋白C、prM（M）和E基因的核苷酸数分别为342、273、225和1485。其相应的氨基酸数分别为114，91，75和495。通过序列分析比较，发现包膜蛋白E最为保守，有3个保守的氨基酸序列，分别位于氨基酸的98-111, 371-378，416-422肽段上。E蛋白基因核苷酸序列与新几内亚C株、牙买加株和S1株的同源性分别为95.0%，97.4%和90.0%。推导的氨基酸序列的类似性分别为96.8%、97.2%和91.4%。C蛋白核苷酸序列与新几内亚C株、牙买加株及S1株的同源性分别为92.7%，95.9%和90.1%。氨基酸序列的类似性分别为94.8%，95.6%和92.3%。上述结果说明我国D2-04株结构蛋白基因的核苷酸及相应的氨基酸序列较类似于牙买加株和新几内亚C株，与S1株的类似性小于新几内亚C株和牙买加株。三种结构蛋白之间的比较说明E蛋白表现较为保守，其次是C蛋白，prM和M较少保守。