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为规范实验室生物安全活动而建立的实验室生物安全管理体系必须得到有效应用，我们认为通过对下文中介绍的一些方法可以达到生物安全管理体系有效运行的目的。它们是管理体系的宣贯培训、日常监督、内部审核、外部审核、管理评审、记录控制等。实验室生物安全管理体系只有有效运行，才能达到规范生物安全相关工作，防止和避免生物安全事故发生的目的。