【摘 要】
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为大量开发SNP用于构建栽培草莓高质量的遗传图谱,以国产草莓品种红星为母本,日本草莓品种红颜为父本构建F1群体,采用SLAF-seq技术和HighMap软件,对2个亲本和200个F1子代群体
【机 构】
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河北省农林科学院石家庄果树研究所,河北省农林科学院,河北省植保植检总站
【基金项目】
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河北省自然科学基金资助项目(C2018301047),河北省高层次人才资助项目(A201802016),河北省科学技术研究与发展计划项目(16226313D-4),河北省农林科学院创新工程项目(C19C0701-03),河北省农林科学院创新团队项目(F20E06001-2),河北省农林科学院青年基金项目(2018100103)
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为大量开发SNP用于构建栽培草莓高质量的遗传图谱,以国产草莓品种红星为母本,日本草莓品种红颜为父本构建F1群体,采用SLAF-seq技术和HighMap软件,对2个亲本和200个F1子代群体进行高通量测序、SNP标记的开发及高密度遗传图谱的构建。通过高通量测序,共获得565919066 reads,平均质量Q30为95.36%,平均GC含量为39.68%,样本GC分布正常。通过生物信息学分析,共获得717881个SLAF标签,2136939个SNP标记,其中有56237个SNP为高质量标记可用于遗传图谱标
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