【摘 要】
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目的:分析HOXD10基因启动子区甲基化水平与基因表达水平的关联并探索HOXD10与肺腺癌临床病理特征和预后的关系。方法:采用R语言拓展包TCGAbiolinks进行基因差异表达分析和差
【机 构】
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株洲市中心医院心胸外科,长沙金域医学检验实验室有限公司
【基金项目】
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湖南省自然科学基金(2017JJ4072)
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目的:分析HOXD10基因启动子区甲基化水平与基因表达水平的关联并探索HOXD10与肺腺癌临床病理特征和预后的关系。方法:采用R语言拓展包TCGAbiolinks进行基因差异表达分析和差异甲基化分析,利用肿瘤基因组计划(The Cancer Genome Atlas,TCGA)项目肺腺癌(lung adenocarcinoma,LUAD)数据集中521例癌症组织和58例癌旁组织的RNA-seq数据分析HOXD10基因差异表达,利用同一数据集中461例癌症组织和32例癌旁组织的甲基化芯片数据分析HOXD10
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