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会计电算化就是把以电子计算机为代表的现代化数据处理工具和以信息论，控制论，数据库以及计算机网络等新兴理论和技术应用于会计核算和财务管理工作中，以提高财务管理水平和经济效益，进而实现会计工作的现代化。医疗机构内部控制制度是为了保证经营活动的高效、有序进行，保护资产的安全和完整而制定并实施的控制方法、措施和程序。医院建立一套适应医疗机构会计电算化系统的内部控制制度势在必行。可以把医疗机构电算化内部控制分为管理控制和日常控制。