基于数据库分析COL1A2在肝细胞癌组织中的表达及对预后的影响

来源 :牡丹江医学院学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yxzapricot
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的 探讨Ⅰ型胶原蛋白α2(COL1A2)在肝细胞癌(Hepatocellular carcinoma,HCC)组织中的表达变化及其对肝癌预后的影响.方法 采用生物信息学方法,通过GEPIA 2.0网络平台,利用TCGA数据分析COL1A2在正常肝组织与HCC组织中的差异表达;通过Kaplan-Meier分析COL1A2表达变化对HCC患者生存率的影响;通过UALCAN在线分析COL1A2与肿瘤分级,肿瘤分期和TP53基因突变的相关性;通过TIMER数据库分析COL1A2表达对肝癌组织免疫细胞浸润的影响;通过GEPIA 2.0网络平台在线分析HCC组织中COL1A2的表达与T淋巴细胞免疫抑制检查点PD-1、CTLA4的相关性.进一步利用GEO数据库综合分析验证COL1A2在肝癌组织的差异表达.结果 COL1A2的表达与HCC的肿瘤分级、肿瘤分期及TP53基因突变呈正相关;COL1A2在HCC组织表达明显上调;生存分析显示癌组织COL1A2的表达量与HCC患者无进展生存率(PFS)和无复发生存率(RFS)相关;COL1A2的表达虽与HCC组织CD8+T细胞浸润呈正相关,但也同时与免疫抑制检查点PD-1,CTLA4的表达呈正相关,提示COL1A2的高表达与HCC的免疫抑制密切相关.结论 COL1A2可在HCC癌组织中高表达,通过促进TP53基因突变,诱导抗肿瘤细胞的免疫抑制与肿瘤的发展及患者生存密切相关,COL1A2可作为HCC预后判断的生物标志物.
其他文献
鼻出血为耳鼻喉科常见症状之一,其病因可分为全身因素与局部因素,其中慢性肝病为中老年人常见的原因之一,但以鼻出血为首发症状的肝癌少见.近5年来,本科共收治2例以鼻出血为首发症状的肝癌患者,现报告如下.rn1 临床资料rn病例1,男,46岁,因“左鼻出血1d”于2017年3月19日收入院.患者既往健康,无高血压及肝病史.(5.1×8.2×6)cm.转上级医院确诊为低分化肝癌,鼻腔未再出血,患者1个月后离世.
进展性脑梗死预后差、致残率高,发病机制复杂.动脉粥样硬化是缺血性脑卒中的基础,而炎症反应与动脉粥样硬化、脑梗死的发生相关[1-2].血浆脂蛋白相关磷脂酶A2(Lp-PLA2)、血浆巨噬细胞移动抑制因子(Macrophage migration inhibitory fac-tor,MIF)作为新的炎性指标,与动脉粥样硬化、心脑血管疾病有关.本研究主要探讨Lp-PLA2、MIF与脑梗死发生、进展的相关性,现报道如下.
颅脑损伤是一种常见的严重创伤性疾病,多由交通事故、高处坠落、挤压等暴力因素引起,患者伤后易出现意识障碍、生命体征紊乱,甚至脑死亡等[1].临床对重度颅脑损伤患者一般采取手术清创,但因伤情危重复杂,手术难度较大、过程持续时间较久,增加了护理风险事件的发生,不利于患者的康复.预见性风险管理是指针对某一特定疾病在护理过程中可能出现的不良反应、并发症等风险问题提前制定相应的干预对策,有效防范风险事件的发生[2].基于预见性风险管理的临床护理路径是指在实施预见性风险管理的基础上依照疾病的发展进程及护理内容的变化为其
由于大多初产妇对孕期相关知识认知有限,容易导致体重增长过快,出现孕期营养过剩,增加难产风险[1].因此,加强孕期体重管理,合理控制体重,对初产妇具有重要意义.有研究显示,全程孕期保健通过给予初产妇孕期知识讲解、评估初产妇自身危险因素并进行正确规避,有利于提高母婴安全,效果显著[2].本研究将其应用于初产妇的护理,观察对其血糖血脂指标及妊娠结局的影响.
目的 探讨刺五加提取物对大鼠酒精戒断后所产生焦虑症的作用以及对大鼠海马中去甲肾上腺素的影响.方法 将60只健康SD大鼠随机分为6组:空白组、模型组、高剂量刺五加组、中剂量刺五加组、低剂量刺五加组和阳性药物组,每组10只.除空白组大鼠腹腔注射生理盐水(15 mL/kg)作为对照外,其他五组腹腔注射20%(w/v)酒精(15 mL/kg),1次/d,持续28 d,制备酒精戒断大鼠模型.造模成功后,空白组和模型组用生理盐水(15 mL/kg)灌胃作为对照;高剂量刺五加组、中剂量刺五加组和低剂量刺五加组分别按照9
目的 探讨BUB1在卵巢癌(Ovarian cancer,OV)中的表达及与预后的关系.方法 利用Oncomine数据库挖掘BUB1在各种肿瘤中的表达;通过GEPIA数据库分析BUB1在卵巢癌组织中的表达,采用Kaplan-Meier数据库分析BUB1在卵巢癌中的预后价值;通过Coexpedia数据库构建BUB1在卵巢癌中的共表达基因网络,并用FunRich软件对score>13的共表达基因注释.利用WebGestalt对其进行KEGG通路富集分析.按score高低筛选出关键基因,GEPIA进一步分析BU
目的 探究去泛素化酶USP39在肝细胞癌(Liver hepatocellular carcinoma,LIHC)中的表达及其与预后、免疫浸润的关系,并预测其生物学功能.方法 从癌症基因组图谱(The cancer Genome Atlas,TCGA)数据库和国际癌症基因组协会(The International Cancer Genome Consortium,ICGC)数据库获取原始数据,采用表达差异分析、临床相关性分析、Kaplan-Meier分析、单因素和多因素Cox分析USP39在评估肝细胞癌患
目的 研究不孕女性亚临床甲减患者经左甲状腺素片(L-T4)治疗后再移植的临床价值,并剖析促甲状腺激素(thyroid stimulating hormone,TSH)水平对其助孕结局的影响.方法 回顾性分析2016年1月至2020年8月间,在皖南医学院第一附属医院生殖医学中心行冻胚解冻移植合并亚临床甲减的203名患者的临床数据,根据是否在移植前服用L-T4干预治疗进行分组,未治疗的移植患者作为对照组即A组(TSH≥4.0 mIU/L,n=87),治疗的移植患者作为研究组即B组(TSH0.05).结论 不孕
目的 探讨经皮经肝胆囊穿刺引流(percutaneous transhepatic gall bladder drainage,PTGBD)联合腹腔穿刺引流(abdominal puncture drainage,APD)治疗重症急性胰腺炎(severe acute pancreatitis,SAP)的临床疗效.方法 选取蚌埠医学院第一附属医院急诊外科于2018年7月至2020年7月间收治的60例SAP患者,依采用或不采用PTGBD治疗,将患者分为观察组(PTGBD+APD组)和对照组(APD组),比较两
目的 采用网络药理学的方法研究方剂玉屏风散的主要活性成分、靶点,初步探讨其治疗系统性红斑狼疮的作用机制.方法 通过TCMSP、Uniprot数据库筛选出玉屏风散的药物活性靶点,通过OMIM、GeneCards、TTD数据库筛选出系统性红斑狼疮疾病相关靶点信息.采用RStudio软件将玉屏风散的药物活性靶点与系统性红斑狼疮疾病靶点信息取交集,将交集靶点数据依靠String在线数据库平台构建蛋白互作PPI网络模型,利用Cytoscape 3.7.2软件,构建可视化的“中药-成分-靶点-疾病”网络图并进行分析,