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目的
明确1个肝豆状核变性(Wilson disease, WD)家系ATP7B基因的致病变异类型及来源,为疾病的诊断及遗传咨询提供依据。
方法收集先证者及其父母和哥哥的外周血样,应用Sanger测序检测该家系4人ATP7B基因21个外显子及其侧翼序列的点突变及小片段插入/缺失,用高分辨比较基因组杂交芯片(array-based comparative genomic hybridization, aCGH)检测先证者ATP7B基因的拷贝数变异(copy number variation, CNV),并通过荧光定量PCR技术(quantitative real-time PCR, qPCR)验证该家系中另外3人ATP7B基因的拷贝数情况。
结果ATP7B基因测序结果显示,先证者携带一个已知致病性杂合变异(c.2668G>A, p.V890M),该变异遗传自母亲,同时发现母亲还携带5个常见的单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism,SNP)位点变异,且均为杂合状态,而父亲及哥哥也携带这5个变异,所不同的是其中两个变异为纯合状态。先证者以上5个SNP均为野生型。高分辨CGH芯片结果显示,先证者ATP7B基因存在大小约4 kb的杂合缺失,包含第2、3外显子,覆盖2个SNP。qPCR结果表明,先证者父亲和哥哥ATP7B基因第2、3外显子的拷贝数约为正常对照的1/2,提示二人携带该片段的杂合性缺失;母亲结果无异常。
结论本研究通过联合使用Sanger测序、CGH芯片及qPCR技术对1个WD家系进行了分子诊断,同时发现了一个新的ATP7B基因致病性CNV,丰富了ATP7B基因的突变谱。