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医药数据相似度计算在药物信息处理中具有重要的作用。传统的文本相似度计算在医药领域并不能取得很好的效果。针对医药数据文本的特殊性,提出基于Relative-IDF的医药数据相似度计算算法。实验结果表明:相比传统TF-IDF、编辑距离等计算方法,基于Relative-IDF的医药数据相似度计算在效率和准确性上都有了很大的提升。