基于高通量测序的野生和养殖台湾白甲鱼皮肤细菌群落多样性分析

来源 :大连海洋大学学报 | 被引量 : 0次 | 上传用户:lanzhengpeng2
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为探究不同地点野生和养殖的台湾白甲鱼Onychostoma barbatulum皮肤细菌菌群组成及其多样性,采用16S rRNA基因V3-V4区高通量测序法,对野生及养殖的成年健康台湾白甲鱼皮肤细菌进行测序及信息学分析。结果表明:台湾白甲鱼皮肤细菌菌群主要分布在18个门,其中变形菌门Proteobacteria、厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes和放线菌门Actinobacteria的菌落数最多;从属水平上看,菌落含量丰富度排名前8的菌主要分布在嗜氢菌属Hydrogenophilus、变形杆菌属Proteus、芽孢杆菌属Bacillus、水栖菌属Enhydrobacter、普雷沃菌属Prevotella、刺骨鱼菌属Epulopiscium、纤维弧菌属Cellvibrio和雷尔氏菌属Ralstonia;功能分析显示,这些菌群主要参与氨基酸代谢、碳水化合物代谢、辅因子与维生素代谢、脂代谢、次级代谢产物合成、能量代谢;通过比较野生和养殖台湾白甲鱼皮肤细菌群落发现,厚壁菌门Firmicutes、拟杆菌门Bacteroidetes、放线菌门Actinobacteria、疣微菌门Verrucomicrobia和酸杆菌门Acidobacteria是台湾白甲鱼中广泛存在的菌群。研究表明,不同地点野生和养殖的台湾白甲鱼皮肤细菌群落组成及多样性存在差异,且野生台湾白甲鱼皮肤细菌菌群远多于养殖组。
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