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为筛选适合我国异种移植研究的猪种提供参考依据，采集近交系海南五指山猪种全血标本6例，利用RT．PCR扩增得到cDNA产物，纯化、克隆、测序得到SLA经典I类P1、P14座位和II类DQA、DQB、DRA、DRB座位基因序列共6个。与Genbank中相关序列进行比较分析发现：所得序列是SLAI类和II类基因的新等位基因。在中国非协调性猪一人异种移植中，海南五指山猪种在与人类MHC遗传基因水平相似性方面有一定优势，可作为备选猪种对相关基因进行必要的修饰和改造。