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以3个云南省大面积推广的玉米杂交种及其亲本为试材，从96对SSR引物中筛选出24对引物，这些引物分布在玉米基因组的10条染色体上，每对引物可以检测到1～6个数目不等的多态性片段(allele)，共97个多态性片段，平均为4．04个，片段大小介于85～300bp之间。在比较分析各试材图谱的基础上，探讨了构建品种指纹图谱的统计学方法，建立了适于种子检验中使用的标准SSR标记指纹图谱。对随机挑选的4个自交系进行了指纹图谱构建的理论与实践验证。