赤潮棕囊藻（Phaeocystis globosa）rDNA ITS区序列变异与二级结构分析

来源 :生态科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：j15890193764

【摘要】

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测定了南海球形棕囊藻香港株P1、P2和湛江株ZhJ1的rDNAITS区序列（含5.8srDNA）,结合GenBank的13条同源序列,比对长度为904bp,变异位点271个,简约信息位点221个,平均（A＋T）（34.5%）〈（G＋C）（6

【作者】

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刘海林章群江启明马奔

【机构】

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暨南大学水生生物研究所,广东省农业科学院花卉研究所

【出处】

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生态科学

【发表日期】

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2010年5期

【关键词】

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球形棕囊藻 rDNAITS区:二级结构序列分析中国近海 Phaeocystis rDNA ITS region secondary structure

【基金项目】

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国家自然科学基金项目（40106014）

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测定了南海球形棕囊藻香港株P1、P2和湛江株ZhJ1的rDNAITS区序列（含5.8srDNA）,结合GenBank的13条同源序列,比对长度为904bp,变异位点271个,简约信息位点221个,平均（A＋T）（34.5%）〈（G＋C）（65.4%）.藻株P1、P2和ZhJ1序列存在变异位点20个,序列间相似性为97.9%～98.5%.ITS序列在种间和种内的解析度高于18srDNA和28srDNA基因;构建的NJ树、MP树、贝叶斯推断系统树的结构是一致的,不同种类的棕囊藻单独聚类,不同地理来源的球形棕囊

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