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研究了微波辅助碱性蛋白酶和风味蛋白酶双酶酶解棉籽粕的工艺条件。通过单因素实验确定了碱性蛋白酶酶解的最佳工艺条件为：微波温度60℃，微波功率500W，酶加量5％（以底物质量计），酶解时间15min；风味蛋白酶酶解的最佳工艺条件为：微波温度60℃，微波功率600W，酶加量5％（以底物质量计），酶解时间15min。参照单因素优化条件，对棉籽粕进行连续酶解，酶解液多肽含量为13．32mg／mL。棉籽粕经过微波连续双酶酶解后，吸油性、起泡性、乳化性等功能性质得到改善。