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番茄的主要病害有病毒病、早疫病、晚疫病、灰霉病、叶霉病、青枯病等；害虫主要有蚜虫、斑潜蝇等。其防治原则按照“预防为主，综合防治”的植保方针，坚持无害化防治原则，达到安全、优质、高效的目的。
一、农业防治
1.选用抗病虫品种
选用抗病虫性强的优良品种，是防治病虫危害最经济有效的技术措施。毛粉802、L-402、佳粉10号、中杂9号等抗烟草花叶病毒；双抗2号抗叶霉病；多丽、R144等有较好的丰产抗病性。
2.轮作倒茬和土壤消毒
凡种过茄科植物或具有与番茄类似病害的田地，要经过3～4年的轮作才能栽培番茄。用50%多菌灵或甲基托布津可湿性粉剂每平方米10g，加干细土10kg配成药土，播种时1/3药土垫在种子下，2/3药土盖于种子上面。
3.适时播种，培育无病壮苗
选择适宜播种期，避开病虫危害高峰期。播前种子要处理。可用10%磷酸三钠溶液常温下浸种20min，并用清水洗净，再在50℃水中浸30min，而后催芽播种，可同时预防病毒病和真菌性病害，或用50%福美双、多菌灵可湿性粉剂用种子量的0.4%拌种，预防真菌性病害。
4.实行科学的田间管理
（1）改进栽培技术。及时清园，采用深耕、夏炕、冬冻等措施，改良土壤结构；应用嫁接育苗技术；采用高垄窄畦栽培，并覆盖地膜，应用微滴灌或膜下暗灌技术；保护地应用消雾型无滴膜，加强棚内温湿度调控，适当控制浇水，及时通风排湿，尽量控制叶面不结露，以控制病害发生。
（2）合理密植和调整植株。根据栽培形式、品种特性和土壤肥力，确定适宜的定植密度。及时整枝、抹杈、吊秧、绑蔓防倒伏，及时清除老、病叶、病残体和虫蛀果。
5.合理施肥
重施底肥，增施磷、钾肥，底肥以有机肥为主，切忌氮肥过多。在定植前15～20d，每亩施腐熟优质有机肥2000kg、50kg三元素复合肥，施肥后深耕耙平，并及时追肥，每次追肥应结合浇水。
二、生物防治
用2%宁南菌素200～250倍液，在发病初期防治病毒病；用1 %农抗武夷菌素150～200倍液，在发病初期防治灰霉病、叶霉病、早疫病。
用1.8%阿维菌素3000倍液或10 %浏阳霉素乳油1000～1500倍液，防治美洲（删除）斑潜蝇、蚜虫等；用72 %农用链霉素可湿性粉剂3000～4000倍液，喷雾防治青枯病等细菌性病害。
三、物理防治
在田间或大棚内，采用黄板涂机油的方法，诱杀蚜虫、斑潜蝇等害虫；利用银灰色反光膜或防虫网、遮阳网等防蚜虫危害，预防病毒病发生。
四、化学防治
在关键期用药防治，先用低毒，低残留农药，采收前20d停止用药。
1.番茄晚疫病
防治方法：发病初期及时进行药剂防治，用64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液或58%雷多米尔锰锌可湿性粉剂500倍液或者72.2%普力克水剂800倍液喷雾，7～10d1次，连续4～5次。
2.早疫病
防治方法：发病初用80%代森猛锌可湿性粉剂500倍液，或64%杀毒矾可湿性粉剂400～500倍液，交替使用，5～7d一次，连喷3～4次。
3.病毒病
番茄病毒病常见的症状有花叶病、条斑病和蕨叶病三种。防治方法：用1.5%植病800倍液喷雾，或用5%的菌毒清水剂200倍液，或20%的病毒A600倍淮幼苗期喷2次，花后每10d一次，连喷3～4次用45%的高效氯氰菊酯乳油2000倍防治蚜蟲。
4.灰霉病
进行化防时要尽量减少施药次数和施药量，并注意轮换和混合施药；预防时，可选用50%朴海因可湿性粉剂1500倍液，或70%甲基托布津可湿性粉剂500～1000倍液；防治时可用22.5%农利灵可湿性粉剂1000倍液加72%农用链霉素可溶性粉剂4000倍液，或亩用200～250g 45%百菌清烟剂熏烟。
5.生理性病害
（1）番茄脐腐病病状：初期幼苗脐部出现水浸状斑点，严重时扩大到少半个果实，后期遇潮湿条件，病斑出现黑色或红色霉状物；病因：水分供应失常及缺钙；防治方法：a地膜覆盖，选用抗病品种。b药剂防治，喷洒1%过磷酸钙，或0.1%硝酸钙，从初花期开始，每隔15d喷一次，连续喷2～3次。
（2）番茄裂果症状：是以果蒂为中心，向果肩部延伸，呈放射状浅裂，多在果实成熟前出现；病因：果实发育后期或转色期遇夏季高温、烈日、干旱和暴雨都会产生裂果；防治方法a、选择抗裂，枝叶繁茂的品种，适当密植，合理间套作。B喷洒0.1%的96%的硫酸铜或喷洒0.1%的硫酸锌，提高抗热性。
6.防治
蚜虫可用10％吡虫啉可湿性粉剂1000倍液或4.5%高效氯氰菊酯1500倍液，并兼治甜菜夜蛾；防治斑潜蝇，用48%乐斯本乳油600～800倍液喷雾。
在使用化学药剂防治病虫害时，要严格执行农药安全使用标准和农药合理使用准则的有关规定，按照无公害蔬菜安全要求，选择合适的药剂、浓度和施药方法，并按规定的安全间隔期用药，应先采摘后施药，采收前7天严禁使用化学杀虫剂，并首选生物制剂或天敌控制，交替使用不同类型的农药。因此发展无公害蔬菜番茄的生产，应从菜田生态系统总体出发，本着经济、安全、有效、简便的原则，优化协调运用农业、生物、化学和物理的配套措施，创造有利于番茄的丰产，而不利病虫害发生的条件，达到高产、优质、低毒、无害的目的，以更好地满足人们对无公害蔬菜的需求。
一、农业防治
1.选用抗病虫品种
选用抗病虫性强的优良品种，是防治病虫危害最经济有效的技术措施。毛粉802、L-402、佳粉10号、中杂9号等抗烟草花叶病毒；双抗2号抗叶霉病；多丽、R144等有较好的丰产抗病性。
2.轮作倒茬和土壤消毒
凡种过茄科植物或具有与番茄类似病害的田地，要经过3～4年的轮作才能栽培番茄。用50%多菌灵或甲基托布津可湿性粉剂每平方米10g，加干细土10kg配成药土，播种时1/3药土垫在种子下，2/3药土盖于种子上面。
3.适时播种，培育无病壮苗
选择适宜播种期，避开病虫危害高峰期。播前种子要处理。可用10%磷酸三钠溶液常温下浸种20min，并用清水洗净，再在50℃水中浸30min，而后催芽播种，可同时预防病毒病和真菌性病害，或用50%福美双、多菌灵可湿性粉剂用种子量的0.4%拌种，预防真菌性病害。
4.实行科学的田间管理
（1）改进栽培技术。及时清园，采用深耕、夏炕、冬冻等措施，改良土壤结构；应用嫁接育苗技术；采用高垄窄畦栽培，并覆盖地膜，应用微滴灌或膜下暗灌技术；保护地应用消雾型无滴膜，加强棚内温湿度调控，适当控制浇水，及时通风排湿，尽量控制叶面不结露，以控制病害发生。
（2）合理密植和调整植株。根据栽培形式、品种特性和土壤肥力，确定适宜的定植密度。及时整枝、抹杈、吊秧、绑蔓防倒伏，及时清除老、病叶、病残体和虫蛀果。
5.合理施肥
重施底肥，增施磷、钾肥，底肥以有机肥为主，切忌氮肥过多。在定植前15～20d，每亩施腐熟优质有机肥2000kg、50kg三元素复合肥，施肥后深耕耙平，并及时追肥，每次追肥应结合浇水。
二、生物防治
用2%宁南菌素200～250倍液，在发病初期防治病毒病；用1 %农抗武夷菌素150～200倍液，在发病初期防治灰霉病、叶霉病、早疫病。
用1.8%阿维菌素3000倍液或10 %浏阳霉素乳油1000～1500倍液，防治美洲（删除）斑潜蝇、蚜虫等；用72 %农用链霉素可湿性粉剂3000～4000倍液，喷雾防治青枯病等细菌性病害。
三、物理防治
在田间或大棚内，采用黄板涂机油的方法，诱杀蚜虫、斑潜蝇等害虫；利用银灰色反光膜或防虫网、遮阳网等防蚜虫危害，预防病毒病发生。
四、化学防治
在关键期用药防治，先用低毒，低残留农药，采收前20d停止用药。
1.番茄晚疫病
防治方法：发病初期及时进行药剂防治，用64%杀毒矾可湿性粉剂500倍液或58%雷多米尔锰锌可湿性粉剂500倍液或者72.2%普力克水剂800倍液喷雾，7～10d1次，连续4～5次。
2.早疫病
防治方法：发病初用80%代森猛锌可湿性粉剂500倍液，或64%杀毒矾可湿性粉剂400～500倍液，交替使用，5～7d一次，连喷3～4次。
3.病毒病
番茄病毒病常见的症状有花叶病、条斑病和蕨叶病三种。防治方法：用1.5%植病800倍液喷雾，或用5%的菌毒清水剂200倍液，或20%的病毒A600倍淮幼苗期喷2次，花后每10d一次，连喷3～4次用45%的高效氯氰菊酯乳油2000倍防治蚜蟲。
4.灰霉病
进行化防时要尽量减少施药次数和施药量，并注意轮换和混合施药；预防时，可选用50%朴海因可湿性粉剂1500倍液，或70%甲基托布津可湿性粉剂500～1000倍液；防治时可用22.5%农利灵可湿性粉剂1000倍液加72%农用链霉素可溶性粉剂4000倍液，或亩用200～250g 45%百菌清烟剂熏烟。
5.生理性病害
（1）番茄脐腐病病状：初期幼苗脐部出现水浸状斑点，严重时扩大到少半个果实，后期遇潮湿条件，病斑出现黑色或红色霉状物；病因：水分供应失常及缺钙；防治方法：a地膜覆盖，选用抗病品种。b药剂防治，喷洒1%过磷酸钙，或0.1%硝酸钙，从初花期开始，每隔15d喷一次，连续喷2～3次。
（2）番茄裂果症状：是以果蒂为中心，向果肩部延伸，呈放射状浅裂，多在果实成熟前出现；病因：果实发育后期或转色期遇夏季高温、烈日、干旱和暴雨都会产生裂果；防治方法a、选择抗裂，枝叶繁茂的品种，适当密植，合理间套作。B喷洒0.1%的96%的硫酸铜或喷洒0.1%的硫酸锌，提高抗热性。
6.防治
蚜虫可用10％吡虫啉可湿性粉剂1000倍液或4.5%高效氯氰菊酯1500倍液，并兼治甜菜夜蛾；防治斑潜蝇，用48%乐斯本乳油600～800倍液喷雾。
在使用化学药剂防治病虫害时，要严格执行农药安全使用标准和农药合理使用准则的有关规定，按照无公害蔬菜安全要求，选择合适的药剂、浓度和施药方法，并按规定的安全间隔期用药，应先采摘后施药，采收前7天严禁使用化学杀虫剂，并首选生物制剂或天敌控制，交替使用不同类型的农药。因此发展无公害蔬菜番茄的生产，应从菜田生态系统总体出发，本着经济、安全、有效、简便的原则，优化协调运用农业、生物、化学和物理的配套措施，创造有利于番茄的丰产，而不利病虫害发生的条件，达到高产、优质、低毒、无害的目的，以更好地满足人们对无公害蔬菜的需求。