【摘 要】
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目的进行雉鸡SSR分子标记的开发。方法在雉鸡分子标记未知的情况下,采用454测序平台结合SSR富集文库测序的高通量测序方法进行雉鸡SSR分子标记的开发,对测序数据进行分析与筛
【机 构】
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上海市动物疫病预防控制中心,上海欣灏珍禽育种有限公司
【基金项目】
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上海市科技兴农重点攻关项目[2017-02-08-00-12-F00069],上海市科技兴农推广项目[沪农科推字(2018)第2-7号],上海市市级农口系统青年人才成长计划(沪农青字(2017)第2-1号).
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目的进行雉鸡SSR分子标记的开发。方法在雉鸡分子标记未知的情况下,采用454测序平台结合SSR富集文库测序的高通量测序方法进行雉鸡SSR分子标记的开发,对测序数据进行分析与筛选。结果获得如下结果:①原始数据经质量过滤后的总reads数为289008条,总碱基数为109667298个,含有SSR位点的序列数为48168条;②单核苷酸重复SSR到六核苷酸重复SSR在雉鸡基因组中均有分布。其中单核苷酸重复SSR数目最多,达25648个,占SSR位点总数的39.33%;双核苷酸和三核苷酸SSR数量亦较丰富,分别为
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