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T细胞免疫缺陷症包括遗传性免疫缺陷和获得性免疫缺陷(见于AIDS患者和强烈化疗和／或放疗后引起T细胞的缺失)。遗传性免疫缺陷症的治疗方法有造血干细胞移植，胸腺移植，T细胞或造血干细胞的遗传修饰等。化疗和／或放疗后引起T细胞缺失的治疗原则是防止感染和提高免疫力。采用效应T细胞的过继性转移等。而对于AIDS患者的治疗主要是抑制HIV的复制。