藏羚羊组蛋白去乙酰化酶1基因编码区的克隆与序列分析

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为探讨藏羚羊的低氧适应机制与高原低氧环境的相关性,采用RT-PCR技术,首次从藏羚羊心肌组织总RNA中克隆出组蛋白去乙酰化酶1(Histone deacetylase1,HDAC1)基因的编码区序列。该序列全长为1449bp,编码482个氨基酸,预测其蛋白质分子量约为55kDa。序列分析表明,藏羚羊HDAC1基因的编码区序列与其它哺乳动物相似性超过90%,其中与牛的相似性最高为98.27%;它的氨基酸序列与其它哺乳动物的相似性达到98.76%~99.59%,显示出极高的保守性。利用邻接法(Neighbor-Joining,NJ法)构建的分子系统进化树聚类结果表明,藏羚羊与牛先聚为一类,该聚类结果与传统的物种进化关系基本一致。藏羚羊HDAC1基因编码区的成功获得,为进一步揭示藏羚羊低氧适应的表观遗传机制奠定基础。
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