【摘 要】
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亲环素是一个多基因家族,在植物生命活动中发挥着重要的作用。该文以大花杓兰(Cypripedium macranthum)为材料,采用RT-PCR技术克隆到1个亲环素基因(Cy P),并对其进行生物信息
【机 构】
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廊坊师范学院生命科学学院; 河北省高校食药用菌应用技术研发中心; 廊坊职业技术学院;
【基金项目】
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国家自然科学基金(31100314);河北省教育厅青年拔尖人才项目(BJ2016045);廊坊师范学院博士基金项目(LSLB201405)
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亲环素是一个多基因家族,在植物生命活动中发挥着重要的作用。该文以大花杓兰(Cypripedium macranthum)为材料,采用RT-PCR技术克隆到1个亲环素基因(Cy P),并对其进行生物信息学分析。结果表明,大花杓兰CyP基因的开放阅读框序列为525 bp,命名为CmCyP(Gen Bank登录号MH411125),编码174个氨基酸。预测CmCyP蛋白是一个位于细胞质、相对分子量约为18 k D、理论p I为8.73、无信号肽和跨膜结构域的亲水性蛋白质。磷酸化和糖基化位点预测分析,发现CmCyP蛋白存在18个潜在的磷酸化位点和2个潜在的糖基化位点。蛋白保守结构域预测,发现CmCyP蛋白包含一个高度保守的肽脯氨酰顺反异构酶结构域,属于单结构域亲环素。二级结构进行预测,发现CmCyP蛋白中存在无规卷曲70个、延伸链56个、α-螺旋23个、β-折叠25个,这4种结构元件在三级结构中也有体现。系统进化树结果显示,大花杓兰CmCyP蛋白与铁皮石斛(Dendrobium catenatum)和万带兰(Vanda hybrid cultivar)Cy P蛋白的亲缘关系较近。本研究首次克隆了大花杓兰亲环素CmCyP基因,为进一步探讨CmCyP的生物学功能奠定了基础。
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