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利用推广Gross-Pitaevskii方程，分别研究了（2＋1）维时空和3维空间的Bose-Einstein凝聚体中涡旋的拓扑结构，这一推广的方程能够被用于非均匀并且高度非线形的Bose-Einstein凝聚系统，利用Φ映身拓扑流理论，给出了基于序参数的涡旋速度场，以及该速度场的拓扑结构，最后，仔细地探讨了这两种Bose-Einstein系统中涡旋的各种分支条件。