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目的
明确我国不同地区流行的狂犬病病毒种群类别及其流行特征。
方法汇总GenBank数据库所有中国狂犬病流行株的N、G和全基因组序列以及国家狂犬病实验室新测定毒株序列,分别构建N基因和G基因种系发生树,明确每个毒株的种群归属。统计各地区流行株的种群类别及不同种群的毒株数量。
结果全国共流行6个毒株群(ChinaⅠ~Ⅵ),云南和湖南是我国大陆种群最丰富省份,均有多达4个群流行;河南、福建等6省份均有3个毒株群流行;上海、江西等8省份皆流行2个病毒种群;北京、天津等14省份目前只监测到1个毒株群流行。优势毒株群ChinaⅠ已蔓延至我国东北部和西部地区,共计覆盖25个省份;China Ⅲ群近年在内蒙古、新疆地区的野生动物中流行且溢出至家畜中;China Ⅳ是青海、西藏地区的流行种群,同时流行于内蒙古、黑龙江地区的野生动物中。
结论我国不同地区狂犬病病毒种群类别和数量差异明显。