基因功能富集分析的研究进展

来源 :中国科学:生命科学 | 被引量 : 0次 | 上传用户：peking521

【摘要】

：

基因功能的富集分析已成为高通量组学数据分析的常规手段,对于揭示生物医学分子机制具有重要意义.目前已有上百种基因功能富集分析的方法和工具.根据所解决的问题和算法的原

【作者】

：

王潇尹天舒李柏逸江熹霖孙慧窦亚光倪琦

【机构】

：

复旦大学生命科学学院生物统计学与计算生物学系; 复旦大学附属儿科医院;

【出处】

：

中国科学:生命科学

【发表日期】

：

2016年04期

【关键词】

：

组学数据功能富集冗余性标准数据集

【基金项目】

：

国家自然科学基金(批准号:91231116,31071113,30971643);国家重点基础研究发展计划(批准号:2012CB316505,2010CB529505)资助

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基因功能的富集分析已成为高通量组学数据分析的常规手段,对于揭示生物医学分子机制具有重要意义.目前已有上百种基因功能富集分析的方法和工具.根据所解决的问题和算法的原理,这些方法可大体分为过代表分析、功能集打分、基于通路拓扑结构和基于网络拓扑结构4大类.本文对这4大类方法的原理及其中的典型方法进行了综述,并讨论了基因功能富集分析结果的冗余性问题及建立标准数据集的必要性.

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