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查尔酮合成酶是植物次生代谢途径中黄酮类物质合成的关键酶。使用同源基因克隆的方法，利用PCR技术从白芨中克隆到该类蛋白基因，命名为BsCHS（Genebank登陆号：KF812890），cDNA全长1629bp，经I）NAStar软件分析，包含一个完整的阅读框，编码390个氨基酸。不同组织的表达特征分析表明，BsCHS在花、茎中的表达较强，在叶和根部次之。蛋白质特征预测及蛋白序列结构分析发现BsCHS具有多个活性位点。序列同源比对表明该基因与蝴蝶兰、文心兰等的CHS基因有很高的相似性。