【摘 要】
：
目的对北京市GII.P16-GII.2型诺如病毒变异株进行全基因组序列扩增及进化分析，了解其基因遗传变异特征。方法采用一步法反转录聚合酶链反应，对2017年北京发现的两株GII.P16-GII.2诺如病毒进行全基因组序列分段扩增及测序，利用DNAStar 7.0、BioEdit进行序列拼接，采用Mega 5.05软件以最大似然法构建进化树，采用SimPlot软件进行相似性分析，并分析其组织血型抗原
【机 构】
：
100013 北京市疾病预防控制中心 北京市预防医学研究中心传染病地方病控制所,100013 北京市疾病预防控制中心 北京市预防医学研究中心传染病地方病控制所,100013 北京市疾病预防控制中心 北
论文部分内容阅读
目的对北京市GII.P16-GII.2型诺如病毒变异株进行全基因组序列扩增及进化分析，了解其基因遗传变异特征。
方法采用一步法反转录聚合酶链反应，对2017年北京发现的两株GII.P16-GII.2诺如病毒进行全基因组序列分段扩增及测序，利用DNAStar 7.0、BioEdit进行序列拼接，采用Mega 5.05软件以最大似然法构建进化树，采用SimPlot软件进行相似性分析，并分析其组织血型抗原结合位点及附近氨基酸变异情况。
结果全基因组及衣壳蛋白区进化树分析显示，北京市2017年发现的两株诺如病毒与其他2016—2017年出现的GII.P16-GII.2型诺如病毒单独形成一个分支。聚合酶区进化树分析显示，这两株病毒与其他2016—2017年的GII.P16-GII.2型、2015—2016年的GII.P16-GII.4 Sydney 2012型混合形成一个分支。与2016年以前的GII.P16-GII.2型诺如病毒相比，衣壳蛋白区及聚合酶区序列进化树分析提示，GII.P16-GII.2 2016—2017与2011年该型诺如病毒分离株进化距离更近。氨基酸序列比较发现，两株病毒组织血型抗原结合位点附近的氨基酸与其他该型别诺如病毒相比，各有一处点突变。
结论北京市2017年发现的两株诺如病毒经全基因分析证实为GII.P16-GII.2型重组株，并且有可能是从2011年发现的GII.P16-GII.2型诺如病毒进化而来。
其他文献
近几年随着材料科学、微电子机械系统迅速发展，推动着检验医学的仪器设备向小型化、集成化、自动化的方向发展。而结合了微流控技术和生物传感器技术的微流控生物传感器的蓬勃发展格外引人瞩目，有望成为检验医学未来应用的一项重要的科学技术。本文就微流控生物传感器特点、技术原理及在分子诊断的应用进展和问题做一简要介绍。(中华检验医学杂志，2018, 41：634-637)
感染性疾病病原诊断在抗菌药物合理应用，疾病流行病学监测和管理以及控制传播等方面发挥着核心作用。理想的感染病现场快速检验方法应具有敏感、快速、特异、稳定、低成本和便于使用的特点。本文概览了POCT在感染病抗原检测、抗体检测、核酸检测等方面的临床应用状况，并重点介绍了微流控技术在病原体多重核酸检测和耐药性检测等方面的优势和潜力。选择合适的时间、合适的场所、正确应用现场快速诊断技术，将为分级诊疗模式下的
目的监测2016年我国引起院内感染的主要病原菌的病原谱分布和对主要抗菌药物的敏感性。方法回顾性收集来自全国12家教学医院的引起院内血流感染(BSI)、院内获得性肺炎(HAP)和院内获得性腹腔感染(IAI)的病原菌。菌株经中心实验室复核后，对其中重要的临床常见菌株进行了抗菌药物药敏实验，采用琼脂稀释法或微量肉汤稀释法测定菌株的最低抑菌浓度，药敏结果判断采用CLSI 2017年M100S(第27版)标
为了应对逐年增多的多重耐药肠杆菌科细菌，多黏菌素再次被临床使用，其耐药状况受到广泛关注。除了染色体介导导致的耐药以外，存在于质粒的mcr－1耐药基因使多黏菌素的耐药性更易传播。本文综述了染色体介导的多黏菌素耐药机制和新发现的质粒介导的耐药机制，包括mcr－1的分布和流行情况、mcr－1介导的耐药和传播机制、基因环境等方面的研究进展和多黏菌素耐药的检测方法等，为应对日益严峻的细菌耐药问题提供信息。(
目前，临床检验正在向两种不同方向发展，一种是高度流水线化的中心实验室，一种是高度集成的便携式检测系统。后者从早期的单个项目检测，逐渐演化为基于微流控技术的集成平台，可以同时执行多个实验步骤和测试，进而形成包括生化、免疫、微生物、细胞学检测的全套微型实验体系，这些基于微流控技术的快速诊断系统将伴随我国的医改进程，下沉到基层的医疗机构甚至家庭。本文综述了目前微流控技术在临床检验领域的应用现状以及未来发
目的对1个F9基因多碱基缺失突变家系进行基因诊断及产前诊断。方法遗传学分析。利用PCR-测序技术检测2013年4月到河南省人民医院咨询乙型血友病家系7例患者F9基因全外显子突变情况，根据患者F9基因突变情况对家系中非乙型血友病患者和100名健康人进行基因检测以排除多态性。根据上述乙型血友病基因检测结果来明确家系中F9基因致病性突变，并指导家系中女性携带者进行产前诊断，建议乙型血友病女性携带者孕中期
肠道菌群和宿主的共生关系是物种经历数百万年共同进化的结果，它们甚至作为宿主的一部分参与和影响机体的生理功能和疾病进程。人体免疫是贯穿生命始终的机体防御系统，机制复杂、影响因素众多，其中肠道菌群对人体免疫的稳态维持发挥着重要的作用。本文就肠道菌群与免疫系统疾病之间的关系做一简单阐述，以期医务工作者及相关领域研究者加深对二者关系的认识，为疾病的预防、治疗及预后提供参考。(中华检验医学杂志，2018,
本文以一个在检验医学一线从事微流控体外诊断研究课题组的视角，扼要阐述了微流控技术的优势以及其在临床检验医学领域的应用前景。文章介绍了微流控体外诊断技术在分子诊断、免疫检测和病原微生物检测等领域中的应用，展示了该技术对于解决临床检验医学痛点问题的价值。作者还探讨了新形势下微流控体外诊断技术的机遇与挑战，并认为微流控技术会对临床检验能力的提升起到巨大的推动作用。(中华检验医学杂志，2018, 41：6
目的研究载脂蛋白A1在人精子中的定位和功能。方法基础研究。收集2017年10至12月来解放军总医院查体的健康男性精液标本20份。采用免疫荧光和免疫印迹来定位载脂蛋白A1在人精子中的部位。设空白对照组、兔多克隆IgG组、10、20和40 μg/ml的APOA1抗体处理健康查体精液标本，37 ℃温箱孵育1、2和3 h后，通过计算机辅助系统(CASA)观察精子前向运动变化，流式细胞分析仪检测精子的凋亡率
目的通过研究缺血性脑卒中发病1～4 d患者的血浆外泌体源性miR－422a表达变化，来探讨其对缺血性脑卒中的诊断价值。方法回顾性研究。收集广西医科大学第一附属医院神经内科2016年5至12月住院诊断为缺血性脑卒中的40例患者和10名同时段在我院体检的年龄性别匹配的健康对照者。通过试剂盒从血浆中提取外泌体源性miRNA，再采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT－PCR)测定缺血性脑卒中不同时相(1、2