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基于现代计算机科学和Node-Link集成管理方法,构建一个多学科模型融合的流域决策支持系统,应用该系统对黑河流域生态补偿和土地利用问题进行了分析说明。结果显示,该系统不仅可以实现和解决多种学科模型的跨时空尺度集成问题,还具有良好的易用性;黑河流域的最佳生态补偿价格为22元m^3,且应该实行严格的生态保护措施,尽量减少对林地、草地的破坏;该系统可为类似流域的综合管理提供科学的决策手段。