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目的探讨医院感染病原菌分布及变化趋势。方法对1999年1月-2007年12月全国医院感染监控网各监测医院报告的病原体进行统计分析。结果共分离出医院感染病原体59 985株,其中革兰阴性菌、革兰阳性菌和真菌分别占48.86%、26.21%、24.21%;在各感染部位分离的病原体中,除胃肠道以真菌为主、血管导管相关以革兰阳性菌为主外,其他均以革兰阴性菌为主,占40.31%～59.00%;在所有病原体中占首位的为白色假丝酵母菌,其次为大肠埃希菌、铜绿假单胞菌、金黄色葡萄球菌和肺炎克雷伯菌;下呼吸道感染居首位的病原体铜绿假单胞菌,泌尿道、血液和手术部位感染居首位的病原体为大肠埃希菌;在病原体构成中1999年1月-2001年12月(第1时段)革兰阴性菌、革兰阳性菌和真菌分别占47.21%、26.83%、25.13%,2005年1月-2007年12月(第3时段)分别占53.20%、23.70%和22.36%,2个时段相比差异有统计学意义;第3时段与第1时段相比增加最多的细菌是鲍氏不动杆菌,从3.89%上升至7.26%,其次为肺炎克雷伯菌、屎肠球菌,分别从5.75%、0.97%上升至8.14%和1.92%;减少最多的细菌是表皮葡萄球菌,从5.15%降至3.22%,其次是乙酸钙不动杆菌,从1.06%降至0.59%。结论医院感染病原体以革兰阴性菌为主,其次为革兰阳性菌和真菌,主要医院感染部位居首位的病原体各不相同;在病原体构成中革兰阴性菌呈上升趋势,革兰阳性菌和真菌呈下降趋势,且有向高度耐药菌集中的趋势。