【摘 要】
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采用分子对接方法研究了杀线虫苏云金芽胞杆菌晶体蛋白Cry5Aa与线虫糖脂受体寡糖片段的互作模式。结果表明:Cry5Aa与寡糖片段的结合位点在晶体蛋白结构域Ⅰ和结构域Ⅱ之间。C
【基金项目】
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湖南省自然科学基金资助项目(12JJ3021)
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采用分子对接方法研究了杀线虫苏云金芽胞杆菌晶体蛋白Cry5Aa与线虫糖脂受体寡糖片段的互作模式。结果表明:Cry5Aa与寡糖片段的结合位点在晶体蛋白结构域Ⅰ和结构域Ⅱ之间。Cry5Aa与寡糖片段的之间作用能主要为构象能,其次为氢键能,而静电作用能为零。二者之间能够形成10个氢键和多个构象能作用。其中晶体蛋白Cry5Aa结构域Ⅰ氨基酸残基T298可与寡糖片段形成3个氢键,并且该氨基酸残基同样对构象能的贡献较大。Cry5Aa与寡糖片段的之间可以形成稳定的复合物。本研究结果对了解苏云金芽胞杆菌晶体蛋白Cry5Aa的毒理机制和开展定点突变提高Cry5Aa杀线虫活性具有指导意义。
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